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Este curso brinda al estudiante conocimientos avanzados en la síntesis química. La base del curso es la síntesis de compuestos orgánicos e inorgánicos con varios pasos de síntesis y diferentes grados de dificultad que se realizarán en el laboratorio. La exigencia es alta y por tanto se pide al estudiante un grado de independencia y de organización muy alto. Los experimentos son acompañados por un seminario dado por los profesores y los estudiantes sobre temas relacionados. Un tercio del curso se realiza junto con profesores del departamento trabajando y sintetizando para su grupo de investigación con el fin de establecer un enlace entre la enseñanza académica y la investigación actual en las diferentes áreas químicas.

Enseñar al estudiante a manejar las estrategias, las técnicas y las oPeñaciones clásicas para la preparación de compuestos inorgánicos, su separación, purificación e identificación. El laboratorio del tercer curso de química inorgánica proporciona al estudiante la planificación y la realización de reacciones en fases sólidas, descubre las propiedades físicas y químicas de sólidos, como la conductividad iónica y eléctrica, la superconductividad, el fotocromismo, etc., de compuestos sólidos. El curso también transfiere el conocimiento de la determinación de las estructuras sólidas por la  difracción de rayos X. En la segunda parte del laboratorio se enfoca en la química de los coloides y sus reactividades y aplicaciones conociendo sus propiedades y sus aplicaciones en experimentos realizados en el laboratorio. El enfoque en la tercera parte del laboratorio es la química bioinorgánica experimentando la extracción de compuestos bioactivos, la caracterización de ellos, la síntesis de compuestos biomiméticos y el comportamiento catalítico de estos compuestos.

Comprender los mecanismos  generales mediante los cuales la célula obtiene y utiliza su energía, y estudiar las propiedades físico-químicas de las moléculas que la forman, por medio de la integración las diferentes vías metabólicas en el organismo. Los temas a tratar serán los siguientes: Importancia del agua en los procesos metabólicos,  composición química de los tejidos. Estructura, propiedades físicas y químicas de Carbohidratos. Glicoproteínas y proteoglicanos. Estructura de Aminoácidos, péptidos y proteínas. Estructura y propiedades de Lípidos, Glicolípidos, glicoproteínas y lipoproteínas. Relación Estructura-Actividad enzimática, Bioenergética, Cinética enzimática, Control enzimático. Estructura Membranas Biológicas, Fenómenos de transporte de membrana, Generación del potencial de membrana. Generalidades sobre el metabolismo. Principales rutas catabólicas citoplasmáticas. Glicólisis aerobia y anaerobia, Principales rutas catabólicas mitocondriales. Cadena transportadora de electrones, Producción de ATP, Metabolismo de Lípidos, Metabolismo del Colesterol, Metabolismo de aminoácidos. Bioquímica de hormonas, Características del sistema endocrino, Receptores hormonales, Hormonas y mecanismo de acción hormonal, esteroidales e hipofisiarias. Bioquímica del sistema nervioso , Bioquímica de la contracción muscular, de la transmisión nerviosa y de los procesos inflamatorios y nociceptivos.

El laboratorio de bioquímica brinda los principios básicos y un estudio de los principales metabolitos primarios involucrados en los procesos bioquímicos celulares. Se tratarán prácticas para ilustrar aspectos como los métodos analíticos de separación aplicados a problemas bioquímicos, Cromatografía líquida de alta eficiencia HPLC, Cromatografía de gases. Métodos de caracterización, Electroforesis de proteínas, Electroforesis de DNA. Métodos de análisis cuantitativo, Espectrofotometría, Técnicas Radioinmunométricas, citometría de flujo.

Lograr que los estudiantes aprendan a hacer cálculos con mecánica cuántica para estudiar la estructura de moléculas y mecanismos de reacciones químicas. Se buscará que se familiaricen con los programas de cómputo más usados hoy por los investigadores. Se abordarán temáticas relacionadas con: los métodos de orbitales moleculares; la teoría de Hartree-Fock-Roothaan. Cálculos con moléculas pequeñas, Ejemplos tipo agua, metano, amoníaco, etc. Cálculos de energía en moléculas mayores,  moléculas orgánicas con diez a veinte átomos de carbono.  Heteroátomos. La teoría de la superficie de energía potencial.  Optimización de geometrías. RecuPeñación del movimiento nuclear después de la aproximación de Born-Oppenheimer,  análisis vibracional. Supermoléculas y reactividad química.  Teoría del Estado de Transición. Estudio de mecanismos de reacciones usando métodos mecanocuánticos. Métodos CI y DFT.

Como complemento a la formación investigativa del estudiante en el programa de Química en el curso trabajo de grado  se realiza un trabajo científico, dirigido por un profesor de planta del Departamento de Química. El Trabajo de Grado consta de la planeación y elaboración de un trabajo producto de la investigación científica en un área de la Química. Los resultados obtenidos en el trabajo de grado se deberán presentar en un documento escrito y presentarse públicamente.